Chaque aliment à tester est broyé dans de l'eau puis un petit volume de l'extrait est placé en présence d'une matrice constituée par des microsphères chargées négativement afin de fixer les cations comme Mg²⁺ ce qui doit permettre d'empêcher l'action éventuelle d'ADNases.

Un passage dans un bain thermostaté à 95°C permet de désorganiser les membranes cellulaires, nucléaires, chloroplastiques afin que l'ADN soit bien libéré (étape particulièrement importante dans le cas d'un aliment végétal frais).

L'ADN d'un aliment (ici graines de soja) certifié sans OGM est extrait dans les mêmes conditions.

L'extraction dure environ 1h . Les extraits , ainsi préparés peuvent être conservés au frigo jusqu'à la séance de TP suivante.