Extraction de la GFP

avec l'ensemble des protéines intracellulaires

de E.coli

Il s'agit de lyser les bactéries génétiauement modifiées, productrices de GFP fluorescente, présentes dans la culture en milieu liquide obtenue au cours de la première étape du protocole.
Concentration bactérienne
Centrifuger 2ml de culture. Conserver le culot. Vérifier qu'il est bien constitué par des bactéries qui expriment la GFP.
Bactéries du culot observées au microscope sous UV (x100), colorées et sans UV (x1000).
Culot bactérien

Lyse bactérienne
Reprendre le culot bactérien avec un peu de tampon Tris-EDTA et bien remettre les bactéries en suspension.
Provoquer la désorganisation partielle de la paroi bactérienne en ajoutant une goutte de lysozyme, enzyme qui dégrade un composé glucidique complexe de cette paroi. Achever la désorganisation de l'enveloppe (paroi et membrane plasmique) des bactéries en les soumettant à un choc congélation-décongélation. La lyse libère les constituants cellulaires solubles en particulier la GFP.

Elimination des débris bactériens
Centrifuger pour sédimenter les débris cellulaires (culot). Récupérer le surnageant qui comprend, en solution, environ 4000 protéines de E.coli et la GFP (ainsi que araC et b-lactamase). Vérifier que la protéine d'intérêt est bien présente.

Le surnageant contient bien la GFP en solution.