Maturation du fluorophore de la GFP

La maturation a lieu dans le "tonneau" constitué par les brins b et les boucles, elle affecte une petite portion de l'hélice a interne. Elle se déroule en 4 étapes.
- Réajustements stériques
Par le jeu des interactions diverses qui interviennent dans le cadre de la mise en place de la structure tertiaire, des torsions amènent le C carbonyle de Ser65 au voisinage du N de Gly67.
- Cyclisation
L'attaque nucléophile du N de Gly67 sur le C carbonyle de Ser65 initie la formation d'un cycle.
- Déshydratation
L'élimination d'une molécule d'eau stabilise le cycle néoformé.
- Oxydation
L'intervention d'O2 permet une déshydrogénation qui conduit à la formation d'une double liaison entre Ca et Cb de Tyr66.

La maturation du fluorophore est autocatalytique. Elle aboutit à la mise en place d'un système conjugué étendu ( avec des électrons délocalisés) qui stabilise la structure par un phénomène de résonance. Ce système est responsable de l'absorption de photons UV suivie de l'émission fluorescente.